水果清洗機的工作原理首先需要清洗的水果全部放入水槽，在高壓水流和強力氣泡的作用下，被充分打散、翻滾、清洗、傳送。水果表面的泥沙會脫落，沉淀到底部隔離倉，防止了翻揚回流造成再度污染。
而從水果上洗落下來的雜物會漂浮在水面，然后被網孔收集，溢出水槽的水流被排除水箱，進入尼龍袋中。水果被水果清洗機洗干凈后，再經過噴淋的清洗，然后通過傳送帶送出，傳送帶末端有一個吹起裝置，沒有被徹底清理掉的雜物吹落。
這款設備的主要部分皆采用優質不銹鋼制作，洗凈度高，能保持原有色澤，廣泛用于清洗水果類農副產品。它主要采用氣泡式清洗、高壓噴淋式清洗、毛刷式清洗、超聲波清洗、滾筒摩擦式清洗等方法。
氣泡式清洗：氣泡式清洗方式是使空氣進入水中，不斷攪動清洗水并且產生大量氣泡，在被清洗物表面發生的氣蝕作用，使被洗物清洗干凈。
高壓噴淋式清洗：高壓噴淋式清洗主要是依靠噴頭噴出的高壓水產生的作用力使附著在水果表面的污物去除。
毛刷式清洗、毛刷式清洗方法是通過刷毛與水中物料的直接接觸，使物料表面的污物刷除洗凈。
超聲波清洗：超聲波清洗方法是在液體中產生數以百萬計的微小真空氣泡，這些氣泡在聲壓作用下急速地大量產生，并不斷地猛烈爆破，產生強大的壓力和負壓吸力，使污物脫離物體的表面，對于被清洗物不會產生物理損傷。該方法用于清洗水果，技術尚不完全成熟，由于超聲波的作用，是否會對水果組織產生不良影響有待進一步研究。
滾筒摩擦式清洗：滾筒摩擦式清洗的滾筒下部沉于水中，物料放在篩網式滾筒中，由于滾筒的滾動作用，使物料與物料之間以及物料與滾筒之間產生摩擦，使物料表面泥土去除并清洗凈，該類清洗兼有去皮的作用，可清洗的水果有局限性。
上一條： 水果清洗機的優勢在哪里？
